Kód pro komplex: De novo návrh pojiva řízený umělou inteligencí 1. Tento přehled Foxe a kol. zkoumá, jak umělá inteligence změnila de novo design pojiva proteinů, což umožnilo rychle generovat vysoce afinitní pojiva pro různé cíle se zlepšenou účinností a sníženými nároky na zdroje. Integrace umělé inteligence do návrhu proteinů znamená významný posun v této oblasti, protože umožňuje vytvářet vlastní pojiva, která mohou neutralizovat toxiny, modulovat imunitní dráhy a zasahovat narušené cíle s vysokou specificitou. 2. Autoři zdůrazňují vývoj designu proteinů od raných snah o racionální design až po současné přístupy řízené umělou inteligencí. Diskutují o tom, jak pokroky v umělé inteligenci, jako je vývoj difúzních modelů a technik hlubokého učení, zvýšily přesnost a flexibilitu predikce a návrhu proteinové struktury. Tato vylepšení umožňují generování pořadačů s přizpůsobenými architekturami a funkcemi, čímž se překonávají předchozí omezení při předpovídání vztahů mezi sekvencí a strukturou. 3. Klíčovou inovací je použití modelů generativní difúze, jako je RFdiffusion, které mohou navrhovat proteiny se specifickými uživatelsky definovanými architekturami a vazebnými geometriemi. Tento přístup v kombinaci s modely návrhu sekvencí, jako je ProteinMPNN, významně zvýšil úspěšnost návrhu pojiva ve srovnání s tradičními metodami. Integrace těchto nástrojů do výkonného řetězce umožňuje in silico generování pojiv s vysokou experimentální úspěšností. 4. Přezkum se také zabývá výzvami a budoucími směry v designu proteinů řízených umělou inteligencí, včetně potřeby lepší prediktivní přesnosti, rozšíření rozsahu cílitelných proteinů a řešení otázek souvisejících s doručováním a imunogenicitou. Autoři dále zdůrazňují důležitost etických aspektů, integrity dat a otevřeného přístupu k výpočetním zdrojům, aby byl zajištěn spravedlivý přístup a zodpovědné používání těchto technologií. 5. Potenciální aplikace pojiv navržených umělou inteligencí jsou obrovské, od neutralizace toxinů a imunitní modulace až po vývoj nových diagnostických a terapeutických postupů. Nedávné úspěchy při navrhování pojiv pro náročné cíle, jako jsou toxiny hadího jedu a imunitní receptory, demonstrují terapeutický potenciál těchto přístupů v reálném světě. Vzhledem k tomu, že se tento obor neustále vyvíjí, je návrh proteinů řízený umělou inteligencí připraven způsobit revoluci v medicíně a biotechnologii tím, že umožní rychlé vytváření vysoce specifických a funkčních proteinů. 📜Papír: #AIDrivenDesign #ProteinEngineering #DeNovoBinders #StructuralBiology #Biotechnology #TherapeuticDevelopment