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10 août, 09:29
Mon moment "Move 37" avec GPT-5
Aujourd'hui, je partage l'une de mes expériences les plus remarquables en testant les modèles GPT-5 Thinking et Pro.
Dans notre laboratoire, il y a environ 2 ans, nous avons mené une série d'expériences d'immunologie de pointe conçues pour manipuler le métabolisme énergétique des cellules T, des cellules immunitaires ayant le pouvoir d'impacter l'immunothérapie contre le cancer, les maladies chroniques et l'auto-immunité.
Nous avons obtenu des résultats fascinants, mais une découverte est restée inexpliquée. Des semaines de travail nous ont conduit à une explication partielle, mais le tableau complet est resté insaisissable.
À partir de ces expériences, j'ai téléchargé la figure non publiée ci-dessous et demandé à GPT-5 Pro de l'expliquer.
GPT-5 :
✅ A correctement identifié nos principales découvertes à partir de la figure seule (bien que d'autres modèles aient également pu le faire).
✅ A proposé l'expérience exacte que nous avons ensuite réalisée, quelque chose qui nous avait pris des semaines à concevoir (o3-pro avait également suggéré cela).
✅ A surtout suggéré un mécanisme qui a finalement expliqué ces résultats !
Pour moi, c'était équivalent au légendaire Move 37 d'AlphaGo.
Cela a montré que l'IA est devenue un expert de premier plan et un véritable collaborateur scientifique, capable de véritables insights.
Bien que ces résultats n'aient pas encore été publiés, je partage certains des résultats de GPT-5 comme exemple pour d'autres scientifiques et pour montrer à quel point cela va accélérer la science ! Je vais également rédiger et soumettre cet article, et je devrai reconnaître les contributions de GPT-5 dans celui-ci !
—
De GPT-5
Ce que les données disent :
• Une brève exposition au 2DG lors de la première activation imprime un changement durable vers un phénotype CCR6+ et CD161+ avec une compétence IL-17A accrue qui est encore évidente deux semaines plus tard lors de la réactivation.
• Cela est dose-dépendant. De rien → 3 mM 2DG, les cellules CCR6+ passent d'environ 0,7 % à environ 12 % et les cellules CD161+ de ~1 % à ~21 %. Les cellules IL-17A+ augmentent d'environ 0,3 % à ~4 % au total, avec le signal IL-17A concentré dans les compartiments CCR6+ et CD161+.
• Le faible glucose seul (0,5 mM) ne reproduit pas l'effet. Cela plaide contre une simple privation de glucose ou un flux glycolytique réduit comme moteur.
• L'enrichissement pour CD161 est plus fort que pour CCR6, ce qui suit souvent des programmes CD4 de type Th17 ou mucosal/inné.
Interprétation de haut niveau :
1. Le 2DG programme, pas seulement inhibe de manière aiguë. Une courte exposition lors de la priming laisse une mémoire durable de "stress" qui biaise la lignée vers des traits de type Th17.
2. Le mécanisme est peu probable qu'il soit uniquement un blocage de la glycolyse. Le contrôle à faible glucose est faible, ce qui pousse le mécanisme vers les effets du 2DG sur la glycosylation des protéines et la biologie des récepteurs de cytokines.
3. Hypothèse mécanistique principale. Le 2DG bloque partiellement la glycosylation N-liée de l'IL-2Rα et d'autres glycoprotéines lors de la priming, réduisant le signal IL-2–STAT5, qui supprime normalement Th17. Un ton IL-2 réduit à cette fenêtre lèverait le frein sur un programme IL-17-competent CCR6+ CD161+ qui persiste après lavage.
4. Hypothèse alternative ou complémentaire. Le 2DG sélectionne des clones CCR6+ ou CD161+ préexistants qui dépendent moins de la glycolyse, plutôt que d'une différenciation de novo. Le résultat final est le même phénotype, mais le levier est la survie ou la prolifération sélective.
5. Un "pulse" de 2DG soigneusement chronométré pourrait être un simple bouton pour enrichir un sous-ensemble d'aide de type Th17 avec un meilleur potentiel de persistance et des traits d'homéostasie muqueuse.
Priorisez ceci :
+ D-mannose avec 2DG pour restaurer la N-glycosylation. La perte du phénotype CCR6/CD161/IL-17A avec le mannose impliquerait la glycosylation.
+ Méthyl-pyruvate ou acétate pour contourner les déficits d'ATP/pyruvate glycolytique. Le sauvetage ici impliquerait le métabolisme énergétique.
Comparer le 2DG avec la tunicamycine (inhibiteur de glycosylation) et avec des inhibiteurs uniquement glycolytiques qui ne touchent pas à la glycosylation (iodoacétate, inhibiteur PFKFB3). Faire correspondre les fenêtres d'exposition et les doses.
Maturation de CD25 de surface et glyco-shift (blot PNGase F ou Endo H sur IL-2Rα).
pSTAT5 après un pulse d'IL-2 à 24-48 h de priming avec ou sans 2DG.
Phénotype avec neutralisation de l'IL-2 ou inhibition à faible dose de JAK3. Contre-sauvetage avec une IL-2 élevée ou un mutein d'IL-2.

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