Très belle critique de BioAI sur les conceptions de nouveaux liants protéiques.
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0567F52 sept., 21:15
Code trop complexe : conception de nouveaux liants pilotée par l'IA 1. Cette revue de Fox et al. explore comment l'IA a transformé la conception de nouveaux liants protéiques, rendant possible la génération rapide de liants à haute affinité pour divers cibles avec une efficacité améliorée et des besoins en ressources réduits. L'intégration de l'IA dans la conception protéique marque un changement significatif dans le domaine, permettant la création de liants sur mesure capables de neutraliser des toxines, de moduler des voies immunitaires et d'interagir avec des cibles désordonnées avec une grande spécificité. 2. Les auteurs soulignent l'évolution de la conception protéique, des premiers efforts de conception rationnelle aux approches actuelles pilotées par l'IA. Ils discutent de la manière dont les avancées en IA, telles que le développement de modèles de diffusion et de techniques d'apprentissage profond, ont amélioré la précision et la flexibilité de la prédiction et de la conception de la structure protéique. Ces améliorations permettent la génération de liants avec des architectures et des fonctions sur mesure, surmontant les limitations précédentes dans la prédiction des relations séquence-structure. 3. Une innovation clé est l'utilisation de modèles de diffusion générative comme RFdiffusion, qui peuvent concevoir des protéines avec des architectures et des géométries de liaison spécifiques définies par l'utilisateur. Cette approche, combinée à des modèles de conception de séquences tels que ProteinMPNN, a considérablement augmenté les taux de succès de la conception de liants par rapport aux méthodes traditionnelles. L'intégration de ces outils dans un pipeline puissant permet la génération in silico de liants avec des taux de succès expérimentaux élevés. 4. La revue aborde également les défis et les orientations futures dans la conception protéique pilotée par l'IA, y compris la nécessité d'une meilleure précision prédictive, l'élargissement du champ des protéines ciblables et la prise en compte des problèmes liés à la délivrance et à l'immunogénicité. De plus, les auteurs soulignent l'importance des considérations éthiques, de l'intégrité des données et de l'accès ouvert aux ressources computationnelles pour garantir un accès équitable et une utilisation responsable de ces technologies. 5. Les applications potentielles des liants conçus par IA sont vastes, allant de la neutralisation des toxines et de la modulation immunitaire au développement de nouveaux diagnostics et thérapeutiques. Les succès récents dans la conception de liants pour des cibles difficiles comme les toxines de venin de serpent et les récepteurs immunitaires démontrent le potentiel thérapeutique réel de ces approches. À mesure que le domaine continue d'avancer, la conception protéique pilotée par l'IA est prête à révolutionner la médecine et la biotechnologie en permettant la création rapide de protéines hautement spécifiques et fonctionnelles. 📜Article : #ConceptionPilotéeParIA #IngénierieProtéique #NouveauxLiants #BiologieStructurale #Biotechnologie #DéveloppementThérapeutique
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